醫(yī)療級基因檢測結(jié)果會更準(zhǔn)確嗎
在疾病尤其是癌癥發(fā)病率和死亡率居高不下、健康管理意識日漸增強、居民消費能力顯著提升的當(dāng)下，基因檢測已被公認(rèn)為是朝陽賽道。
基因檢測市場主要分為消費級基因檢測產(chǎn)品和醫(yī)療級基因檢測產(chǎn)品。醫(yī)療級基因檢測解決的問題報告、疾病的診斷和治療、出生缺陷的預(yù)防、不孕不育和優(yōu)生優(yōu)育。我們主要說的是遺傳病檢測領(lǐng)域。
大家一聽到基因檢測都會有疑問“這也可以檢測么？”、“基因檢測是智商稅嗎？”、“基因檢測到底準(zhǔn)確嗎？”……
那么，都2022年了，基因檢測到底是更精確還是依舊是智商稅？
遺傳病檢測領(lǐng)域
基因是遺傳的基本單位，通過決定蛋白質(zhì)的表達(dá)進(jìn)而影響人類的生老病死，隨著細(xì)胞分裂基因也在不斷的復(fù)制，復(fù)制過程中會引入一些錯誤，即變異，大部分變異是良性的，但也會有極少的變異是致病性的，若變異存在于生殖腺中，就有可能遺傳給下一代，即遺傳性疾病。
基于檢測目的可分為診斷和篩查兩大類:
診斷
即為遺傳病患者遺傳病因的分析，直接面向患病人群。首要解決的問題是解答病人究竟得了什么病，接下來根據(jù)疾病的遺傳學(xué)診斷結(jié)果做出診療方案。但是目前大多數(shù)遺傳病還沒有精準(zhǔn)治療的方案，尚處于對癥治療的階段。腫瘤用藥的選擇目前是基因檢測精準(zhǔn)治療的一個主要應(yīng)用方向。對于無法治療的遺傳病，除了診斷，基因檢測診斷結(jié)果明確的患者可通過第三代試管嬰兒的技術(shù)阻斷遺傳變異向下一代的傳遞。
篩查
即為對目標(biāo)疾病或變異的檢測，面向的是正常人群或者尚未發(fā)病的人群。比如遺傳病攜帶者篩查，人并非有了致病變異就會得病，常染色體隱性遺傳病和X連鎖隱性遺傳病需要攜帶純和或者復(fù)合雜合致病變異才會發(fā)病，雜合變異僅為攜帶者，本人不會患病，但若配偶也為相同基因致病變異攜帶者，后代則有患病的風(fēng)險，通過攜帶者篩查結(jié)合第三代試管嬰兒技術(shù)即可避免部分遺傳病患兒的出生，達(dá)到優(yōu)生優(yōu)育的目的；又比如新生兒遺傳代謝病篩查，部分?jǐn)y帶遺傳代謝病致病突變的新生兒可能尚未發(fā)病，若提早發(fā)現(xiàn)，早干預(yù)，早治療，可避免出現(xiàn)不可逆的損傷。
變異致病性的解讀
這是目前基因檢測最關(guān)鍵的部分，需要綜合大量信息，主要分為3個方面：
正常對照人群的數(shù)據(jù)患者病例研究的資料分子遺傳學(xué)的基礎(chǔ)知識
1.正常對照人群數(shù)據(jù)
正常對照人群數(shù)據(jù)，致病變異出現(xiàn)的概率是較低的，同時患病人群的生存生育能力相對較差，所以致病變異在正常人群中大量積累的可能性是很低的，也就是說若一個變異在正常人群中的頻率較高，那么大概率那個變異是良性的，隨著基因組學(xué)的推進(jìn)，此數(shù)據(jù)庫越來越豐富，最初的千人基因組數(shù)據(jù)庫有1,252份數(shù)據(jù)，具體到人種僅252個東亞人的數(shù)據(jù)，而現(xiàn)在常用的gnomAD數(shù)據(jù)庫（）有125,748份全外顯子數(shù)據(jù)和15,708份全基因組的數(shù)據(jù)，其中有近萬例東亞人的數(shù)據(jù)，良性變異的解析能力大大提升。數(shù)據(jù)庫不止容量在增大，分析內(nèi)容也越來越豐富，以前僅有點突變的數(shù)據(jù)，隨著全基因組數(shù)據(jù)的增多和全外顯子算法的精進(jìn)，還增加了人群基因組結(jié)構(gòu)變異、基因無功能變異和錯義變異致病性等分析內(nèi)容。
2.患者病例研究資料
除了正常人群數(shù)據(jù)庫，患病人群的文獻(xiàn)、數(shù)據(jù)庫資料也在不斷的積累，截至2021年11月13日，ClinVar數(shù)據(jù)庫（）已有1,873,752條變異記錄，極大的增強了變異致病性評估的能力（每個人身上都會有很多的變異，并且在不停的產(chǎn)生變異，變異的解讀需要文獻(xiàn)和數(shù)據(jù)庫的證據(jù)支持，一個沒有文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫記錄的錯義突變是很難確定其致病性的，僅能評級為臨床意義未知，需要結(jié)合受檢者的疾病家族史才有進(jìn)一步提升的可能，然后大多這類變異都只能等待研究資料的報道，積攢到足夠的證據(jù)后才能進(jìn)行致病性的定性）。ClinGen數(shù)據(jù)庫專家組已經(jīng)發(fā)布了2852個變異的致病性評級，可以直接使用。OMIM數(shù)據(jù)庫（）每個月都會有數(shù)十個新的基因公布。所有這些不斷更新的數(shù)據(jù)庫文獻(xiàn)資料都在不斷的增強變異的解讀能力。
3. 分子遺傳學(xué)的基礎(chǔ)知識
隨著基因檢測應(yīng)用的普及，對于分子遺傳學(xué)的理解也在不斷的加深，最明顯的是行業(yè)規(guī)范指南的發(fā)布和普及，2015年發(fā)布的ACMG指南僅為一個框架，應(yīng)用上只有經(jīng)驗豐富的從業(yè)者才能駕馭，以無功能變異為例，2015年的指南僅數(shù)十文字的陳述，而現(xiàn)今有成套的體系流程。
2015年ACMG無功能變異操作描述
目前ACMG無功能變異操作描述
總結(jié)
隨著正常人群數(shù)據(jù)庫和患者病例文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫資料的豐富，以及對遺傳病知識了解程度的加深，基因檢測的準(zhǔn)確性已經(jīng)大幅度的提高，但還有很多問題尚待解決，需要行業(yè)同仁繼續(xù)努力。大家也可信任醫(yī)療級基因檢測的報告，相信未來的醫(yī)療會更加先進(jìn)。
